前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
龙木集序卷之一龙木总论一 审的歌发挥二 眼叙论三 三因证治四 五轮歌五 内障眼法根源歌六 针内障眼法歌七 针内障眼叙法歌八 小儿歌九 合药矜式十 煎药诀十一 服药须知十二 点眼药诀卷之一七十二证方论一
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
前言第一章 常见症状辨病第一节 发热一 正常体温及生理变异二 热度高低辨病三 体温上升期分型辨病四 高热持续期分型辨病五 体温下降期分型辨病六 发热伴随症状辨病第二节 疼痛一 观察疼痛时注意事项二 头
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七卷十八卷十九卷二十卷二十一卷二十二卷二十三附录
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
初生沐浴噤风撮口脐风气闭啼伤风咳嗽疟吐吐泻霍乱积痢疳肿胀惊风惊风死症歌脉法慢惊慢脾风毒惊瘫鹤膝候痫腹痛虫心痛咽喉暑脱肛热黄胆淋症（附白尿）眼目赤肿痧疹
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿