卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
序一序二序三序四序五自启重刊卫生宝鉴后序补刻卫生宝鉴后序卷一春服宣药辨革春服宣药歌无病服药辨古方名实辨承气汤辨阴盛阳虚汗之则愈下之则死阳盛阴虚下之则愈汗之则死汗多亡阳下多亡阴方成弗约之失卷二灸之不发脱
第1部分第2部分第3部分
卷上胎前恶阻子烦子悬子肿子满子气子喑子痫子淋子嗽子疟心腹痛腰胁痛下血尿血转胞胎气上逼脏躁胎动胎痛孤浆吐血伤寒痢疾泄泻霍乱伤食盅鸣堕胎胎不长鬼胎伤胎肠覃石瘕卷中产后难产胎衣不下血晕厥恶露不下恶露不绝血崩
本事方续集
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
重修本草之记重修证类本草序政和新修经史证类备用本草序证类本草所出经史方书卷第一嘉补注总叙本草图经序开宝复位序唐本序梁·陶隐居序上合药分剂料理法则补注所引书传林枢密重广本草图经序雷公炮炙论序新添本草衍义
正文附经目屡验良方
《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
卷一医说五脏六腑脉病虚实肝脏脉病虚实心脏脉病虚实脾脏脉病虚实肺脏脉病虚实肾脏脉病虚实胆经虚实病候小肠虚实病候胃经虚实病候大肠虚实病候膀胱经虚实病候三焦虚实病候五脏补泻主治例十二经络奇经八脉诊脉七表八里