序一序二序三凡例寒性药品苦参升麻葛根柴胡前胡甘草黄连黄芩黄柏知母干地黄熟地黄芍药（白赤）大黄青皮枳壳枳实猪苓泽泻木通栝蒌桑白皮葶苈子滑石薄荷防风天门冬麦门冬牡丹皮红蓝花苏木栀子桃仁连翘地榆石膏马兜铃枇
《雷公炮炙论》序上卷朱砂云母钟乳白矾硝石芒硝滑石曾青太一禹余粮黄石脂黄精菖蒲人参天门冬甘草干地黄菟丝子牛膝葳蕤防葵柴胡独活升麻车前草木香薯蓣薏苡仁泽泻远志龙胆细辛石斛巴戟天黄连络石蒺藜子黄肉苁蓉蒲黄续
序卷上十干脏腑配合十二支脏腑经络配合手足经络配天地四时合主表里阴阳脏腑经络病证内外八邪内外病生四类九气五邪五邪微甚十干夫妇配合成五运五运太过不及十二支应六气三阴三阳六气有余不足六气五运应五脏主病六气为
序一序二集解序卷上诊候入式歌五脏歌心脏歌一心脏歌二心脏歌三肝脏歌一肝脏歌二肝脏歌三脾脏歌一脾脏歌二脾脏歌三肺脏歌一肺脏歌二肺脏歌三肾脏歌一肾脏歌二肾脏歌三左右手分诊五脏四时脉歌左手寸口心脉歌左手关部肝
验方徐果亭先生试验神方送蛋药酒方（男人服）种子红药连城丸老奴丸（一名苍龙丸）又种子奇方种子金丸种子金丸如意线方长龟方（一）秘传壮阳固精酒奇妙方涤痿兴阳汤安息香闻香起马方治腰痛神方补腰益肾壮元阳补血气圣
序证治总纲治病须明阴阳虚实论治病必审四时用药说辨症订方必先审四诊记用药宜精审慎勿疏忽记胃为生化之源记保身可以却疾说侍疾应知论疟咳嗽记中风肿胀辨虚劳说幼科治验记胸胁腹痛肝胃气逆辨温热温疫辨
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
序一序二医之可法为问卷之一医学指南总诀二首卷之一本草第一药本五味一首药性指掌九十首妊娠服禁引经药报使六陈十八反(二首并出儒门事亲)十九畏(一首)用药法象(一首)卷之二脉诀第二诊脉入式(一首集次王适斋等
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
《滇南本草》序一《滇南本草》抄本跋《滇南本草》抄本后序重刊《滇南本草》序《滇南本草》序二第一卷石莲花木贼贯众七星草石苇白果松节、松笔头、松香、地盘松球侧柏叶玉兰花野棉花云连白芍、赤芍牡丹皮鸡头实荷叶藕