卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
简介祖剂细目祖齐小叙卷之一卷之二卷之三卷之四
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖
局方发挥
引言卷一御纂《医宗金鉴》疹门心法要诀疹原麻疹轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹附司天掌诀歌《专治麻痧》述古编叙卷二钱
脉诀阐微
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药
序题辞凡例总论第一延医法论第二表论第三里论第四寒论第五热论第六虚论第七实论第八辨惊风之误论第九不可饿论第十治痘论第十一治疹论第十二
序自序小儿要略论看小儿病状歌虎口三关古人辨色看危症法小儿正面初生门脐风门惊风门胎热门发热门感冒门伤风门伤寒门伤暑门伤食门咳嗽门喘急门咳血门呕吐门霍乱门吐泻门泄泻门痢疾门腹痛门疟疾门疳积门痫症门烦渴门腹