卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
序卷一论疮疡二十六脉所主（一）论疮疡五善七恶主治（二）论疮疡当明本末虚实（三）论疮疡用针宜禁（四）论疮疡欲呕作呕（五）论疮疡用汗下药（六）论疮疡围寒凉之药（七）论疮疡泥用定痛散（八）论疮疡用生肌之药（
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹
序上籍食治养老益气方第一食治老人眼目方第二食治老人耳聋耳鸣诸方第三食治老人五劳七伤诸方第四食治老人虚损羸瘦诸方第五食治老人脾胃气弱方第六食治老人泻痢诸方第七食治老人烦渴热诸方第八食治老人水气诸方第九食
陈序华序柯序原序卷上治虚脉法总括治虚脉法分类治虚有三本治虚二统阳虚三夺统于脾阴虚之症统于肺虚症有六因心肾论心肾不交论心肾不交与劳嗽总论五交论吐血论红症初起治法劳嗽症论劳嗽初起治法干咳嗽论咳嗽痰中带血珠
本草纲目别名录
卷之一要书说六经图足太阳膀胱经手小肠足阳明胃经手大肠足卲阳胆经手三焦足太阴脾经手肺足少阴肾经手心足厥阴肝经手心胞伤寒纲领伤寒论伤寒标本表里虚实发表之药用温攻里之药用寒温里之药用热论十六种治法一 伤寒二
序凡例九针式卷一难经一、补泻二、补泻相反三、针刺浅深四、先后浅深五、井荥俞经合主病六、四时井荥俞经合刺七、脏腑荥俞合皆以井为始八、脏腑井荥为五六九、阴阳井荥木金相生不同十、出井入合十一、欲刺井当刺荥十