序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
弁言序调经门总论精血论养血论调气论辨色论多少论先期后期论居经论泄泻论身痛论痛经论经漏论不利论过期论经闭论枯血论血劳论血崩论痰气污血论杀血心痛论带下论白浊白淫论虚劳门冷劳热劳骨蒸劳血风劳胎前门总论胎前调
序卷第一述增损旧方用药犯禁决述旧方合药法述看方及逆合备急药决治胸痹诸方治胸胁痰冷气满诸方治心痛腹胀满冷痛诸方治下利诸方治咳嗽上气诸气治气逆如奔豚状并诸汤方治虚满水肿诸方卷第二治头面风（论杂风状）诸方治
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
简介杂病·自叙杂病·卷第一 诸中门·诸伤门·寒热门杂病·卷第二 诸气门杂病·卷第三 诸呕逆门·诸血门杂病·卷第四 诸痛门·痿痹门杂病·卷第五 诸风门·神志门·杂门杂病·卷第六 大小腑门杂病·卷第七 七
黄帝内经素问遗篇
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
刘叙自叙凡例卷一多读书论脉位法天地五行论提纲论因形气以定诊论运气论太素脉论审象论脉有亢制论冲阳太二脉论脉有不可言传论脉无根有两说论调息已定然后诊脉论问情论卷二卷三浮脉（阳）沉脉（阴）迟脉（阴）数脉（阳
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽
湖岳村叟医案