林序皇甫序序例卷一精神五脏论第一五脏变第二五脏六腑阴阳表里第三五脏六腑官第四五脏大小六腑应候第五十二原第六十二经水第七四海第八气息周身五十营四时十分漏刻第九营气第十营卫三焦第十一阴阳清浊精气津液血脉第
十二经补泻温凉引经药歌
序凡例卷上温病总论伤寒温病辨（四则）风温上焦篇风温中焦篇风温下焦篇卷下湿温上焦篇湿温中焦篇湿温下焦篇附温病治法要略附方
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
难经本义
宣明方论
自序集之一·初生门证治通论钱氏论五脏所主五脏病五脏相胜洁古论五脏五邪相乘补泻大法五脏补泻法察色听声脉法死证襁褓乳哺乳儿法乳令儿病证哺儿法断乳法杂将护法集之一·初生门初生拭口法浴儿法断脐法灸脐法裹脐法服
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
袁序陆序陆序自序卷一原因原贼邪原风湿原荣卫原易伤寒温热延医论论河间说伤寒之误原瘴原痧原胎成注《伤寒论》论五志论阴阳交并论虫论温疫总论疟论尸疰疳蒸四大症论虚劳论传尸劳论肺萎论正水风水诊法论女劳疸黑疸同治