第1部分第2部分
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
序一序二卷之上杂病门疟消渴喉痛肠痈肩痈咳嗽疮疡瘾疹疥癣酒鼻健忘痨瘵咳血肺痿痿怖赫曦（?）温病手心热发热饮酒发热香港脚梦遗淋小便不通泄泻膈噎伤食卷之下大风痛风疝内伤中风暑注夏暑风湿郁病火溺血痰饮肺胗杂合
序叙自叙御定医宗金鉴麻疹卷一疹原轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治卷二身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音牙疳呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹卷三 （附采诸家麻后证治）麻后龟胸麻后肺痿
医话
脉诀阐微
扁鹊神应鍼灸玉龙经
难经正义
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑