正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天
序一序二序三序四序五述古八则麻疯二十一论麻疯三十六种辨症图说五不治（轻亦可治）五主治内治九法外治六法疯门总论疯门总药正治诸方变治诸方攻下诸方外治诸方点痣法瘰烂法雷火针法千金方
疔毒血痣骨槽风舌菌牙菌牙岩舌岩舌疳锁喉毒盘槽痈对口瘰失荣乳岩井疽蔽骨疽石疽疵疽附骨疽串臂漏肛漏肝痈附论肺痈漫心痈马刀肾俞发少腹痈缩脚痈流注肾岩脱囊伏兔痈眼胞痰瘤脾肚发肠覃胃脘痈舌根痈鹤膝风附论麻风论鸡
管序黄序总论十二时气血流注歌发散方十三味总方十四味加减方七厘散飞龙夺命丹地鳖紫金丹三十六大穴图说少林寺秘传内外损伤主方损伤补药方王瑞柏损伤用药论十全大补汤四物汤四君子汤八珍汤补中益气汤六君子汤加味承气
医家秘奥之脉法解
产宝诸方
秘传刘伯温家藏接骨金疮禁方
张序卷上卷下跋
序卷一脉形状指下秘决第一（二十四种）平脉早晏法第二分别三关境界脉候所主第三辨尺寸阴阳荣卫度数第四平脉视人大小长短男女逆顺法第五持脉轻重法第六两手六脉所主五脏六腑阴阳逆顺第七辨脏腑病脉阴阳大法第八辨脉阴
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论